Oui, enfin pas sûr que dans ce cas le réel problème soit Facebook. Je gère plusieurs site ou FB connect est intégré mais rien n'oblige l'utilisateur de s'enregistrer avec son compte FB pour pouvoir commenter les articles, il peut commenter de manière plus classique (pseudo, email, url de site).
C'est peut-être aux utilisateurs de devenir méfiant vis à vis des sites qui ne proposent pas de solutions alternatives à FB pour commenter.
J'irai même jusqu'à dire que les webmasters/concepteurs de site doivent aussi se méfier de FB connect, et surtout du système de commentaires proposé par FB. Car les commentaires, le contenu qui est produit par ceux-ci n'appartient plus aux webmasters mais à FB...